CV
Education
- B.S. Dezhou university, 2010-2014
- M.S. UESTC, 2014-2016
- Ph.D UESTC, 2016-2018
- Ph.D joint-training UChicago, 2018-Now
Skills
- Bioinformatics
- Statistics
- python
- R
Talks
2018 第12届计算系统生物学国际会议 / 贵阳,中国 / 分会场报告
Research
- 新基因的起源与演化
生物在演化过程中伴随着新基因的产生,新基因或者称为年轻基因(young gene)指的是对于所要研究的个体,最近才产生的基因。因此,新基因(年轻基因)在远缘的物种中不存在,仅仅存在于近缘的物种中。新基因促进了生物表型的演化。该研究兴趣主要以果蝇为模型,基于第三代测序技术注释不同果蝇物种的基因年龄,更加精细地推断新基因的起源机制,以及新基因在演化过程种所扮演的功能。
- 抗CRISPR-Cas蛋白(Acrs)和CRISPR-Cas系统
CRISPR-Cas是细菌广泛采用的免疫机制,可以对抗噬菌体和其它可移动元件的入侵;Acr则是噬菌体采用的对抗细菌CRISPR-Cas系统的反制措施。两者很好的体现了演化中的“红皇后假说”。该研究兴趣主要基中在CRISPR-Cas的识别,注释分类;Acrs的生物信息学发现,以及两者之间的共进化关系。
- 癌基因组演化
根据分子和遗传学上的相似性,众多癌症可以归为一种类型。2018年cell上一篇文章提供了癌症分型最全、最精细的图谱。癌细胞的产生可以看作是一种逆演化过程。该研究兴趣试图探究新基因对于肿瘤发生、发展的影响。尤其是年轻的LncRNA与之相关的关系。